Во ова Одделение се обработуваат  поберидбените процеси на тутунот и тоа: нажолтување, сушење, манипулација, ферментација и чување на тутунот. Исто така се проучуваат и технолошките постапки од фабрикацијата се до изработка на готов производ - цигара. Во доменот на сушење на тутунот веќе се дадени и комплетни решенија кон намалување на трошоците на сушењето со изградба на комбинирани сушници. Во лабораториите на ова одделение комплетно се испитуваат физичките, водно-физичките и други технолошки  својства на тутунот.